Utom sin doktorsavhandlingErkjendelsens Problem (1875) författade Wilkens tre sociologiska skrifter: Livnydelsearbeide (1874-1876; i tre särskilda avdelningar), Samfundslegemets Grundlove (1881), Det produktive Samfund (1904), vidare Aestetik i Omrids (1888) och Poesien. En Fremstilling af Poetikken på psykologisk Grundlag (1893) och Filosofisk Propedeutik (1904).