Calicivirus
| Calicivirus | |
 Bild tagen i elektronmikroskop av noroviruset | |
| Systematik | |
|---|---|
| Rike | Orthornavirae |
| Stam | Pisuviricota |
| Klass | Pisoniviricetes |
| Ordning | Picornavirales |
| Familj | Calicivirus Caliciviridae |
Calicivirus är en familj av enkelsträngade RNA-virus som orsakar vinterkräksjukan. Här är särskilt norovirus och sapovirus inblandade; båda orsakar magsjuka hos människan. De ger likartade symtom: hastigt påkommen kräkning och/eller diarré, ofta kombinerat med magont och feber. Symtomen kan vara i ett till flera dygn. Sjukdomen förekommer vanligast under vinterhalvåret från november till april.
Sjukdomen är mycket smittsam. Det behövs endast en liten smittdos för att ge upphov till sjukdom. Inkubationstiden är kort, 12–48 timmar. Den smittar genom kontaktsmitta via förorenade händer, ytor och föremål. Den smittar även genom droppsmitta, framför allt i samband med kräkningar, och genom förorenade livsmedel.[1] Handsprit hjälper inte mot viruset, utan bara god hygien, med mekanisk rengöring med tvål och vatten, efter .[2]
Calicivirus tillhör en större familj av virus som består av tretton arter, uppdelade i elva släkten.[3] Förutom de virus som orsakar vinterkräksjuka finns även andra virus inom familjen som orsakar sjukdomar hos djur, såsom kattens calicivirus (andningssjukdom), kaninens hemorragiska sjukdomsvirus (ofta dödlig hepatit) och Norwalk-gruppen av virus (gastroenterit).[3] [4]Calicivirus infekterar naturligt ryggradsdjur och har påträffats hos en mängd olika organismer som människor, nötkreatur, grisar, katter, höns, reptiler, delfiner och amfibier.
Calicivirus har en enkel uppbyggnad och är inte höljesvirus. Deras kapsid har en hexagonal/sfärisk form och icosahedral symmetri (T=1[5] eller T=3[6][4]) med en diameter på 35–39 nm. [7]
Etymologi
[redigera | redigera wikitext]Calici- kommer från det latinska ordet calyx och det grekiska ordet kalyx. Orden betyder en kopp eller kalk, en calix. Detta kommer från att stammarna har synliga koppformade fördjupningar
Taxonomi
[redigera | redigera wikitext]De följande släktena erkänns:[8]
- Bavovirus
- Lagovirus
- Minovirus
- Nacovirus
- Nebovirus
- Norovirus
- Recovirus
- Salovirus
- Sapovirus
- Valovirus
- Vesivirus
Ett antal andra calicivirus förblir oklassificerade, inklusive hönscalicivirus.
Livscykel
[redigera | redigera wikitext]Viralt replikation sker i cytoplasman. Virus kommer in i värdcellen genom att binda till specifika receptorer på cellens yta, vilket leder till endocytos. Replikationen följer mönstret för positiv-strängade RNA-virus. För transkription används en metod som är typisk för denna virusklass. Translationen sker genom en process som kallas läckande scanning, och RNA-terminering följt av återinitiering. Ryggradsdjur fungerar som de naturliga värdarna för viruset. Smittspridningen sker via fekal-oral överföring. [4]
Historia
[redigera | redigera wikitext]Att fastställa den virala orsaken tog många decennier på grund av svårigheterna att odla viruset i cellodling. På 1940- och 1950-talen, både i USA och Japan, kunde calicivirus inte odlas i kultur, men som ett experiment gavs bakteriefritt filtrat från diarré till frivilliga för att undersöka om virus fanns i deras avföring.[9] Dessa experiment visade att icke-bakteriella, filtrerbara agens hade förmågan att orsaka tarmsjukdomar hos människor.[9] 1968 ledde ett utbrott på en grundskola i Norwalk, Ohio (Norwalk-virus) till att avföringsprover återigen gavs till frivilliga och passagerades till andra personer. Slutligen, 1972, isolerade Kapikian och hans kollegor Norwalk-viruset från frivilliga genom att använda immun-elektronmikroskopi, en metod som innebär att man direkt undersöker antikropp-antigen-komplex.[9] Klassificeringen av denna Norwalk-virusstam blev prototypen för andra arter och små, rundformade virus som senare kom att kallas Norovirus.[9]
Referenser
[redigera | redigera wikitext]- ^ ”Caliciviridae - Caliciviridae - Positive-sense RNA Viruses - ICTV” (på english). Arkiverad från originalet den 25 maj 2014. https://web.archive.org/web/20140525232438/http://www.vardhandboken.se/Texter/Personalinfektioner-inom-halso--och-sjukvard/Calicivirus/. Läst 12 mars 2021.
- ^ Vinjé, J; Estes, MK; Esteves, P (30 januari 2014). ”ICTV Virus Taxonomy Profile: Caliciviridae.”. The Journal of General Virology. http://www.dn.se/ekonomi/600-drabbade-av-vinterkraksjuka/. Läst 31 januari 2014.
- ^ [a b] Vinjé, Jan; Estes, Mary K.; Esteves, Pedro; Green, Kim Y.; Katayama, Kazuhiko; Knowles, Nick J. (2019-11-01). ”ICTV Virus Taxonomy Profile: Caliciviridae” (på engelska). Journal of General Virology 100 (11): sid. 1469–1470. doi:. ISSN 0022-1317. https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/jgv/10.1099/jgv.0.001332. Läst 6 januari 2025.
- ^ [a b c] ”Viral Zone”. doi.org. ExPASy. http://viralzone.expasy.org/all_by_species/32.html. Läst 15 juni 2015.
- ^ ”T=1 icosahedral capsid protein ~ ViralZone”. viralzone.expasy.org. https://viralzone.expasy.org/1057.
- ^ ”T=3 icosahedral capsid protein ~ ViralZone”. viralzone.expasy.org. https://viralzone.expasy.org/806. Läst 6 januari 2025.
- ^ Hansman, Grant Stuart (2010). Caliciviruses: molecular and cellular virology. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-63-9. Läst 6 januari 2025
- ^ R.E.F. Matthews, red (1982-07-14). Classification and Nomenclature of Viruses. S. Karger AG. ISBN 978-3-8055-3557-1. https://doi.org/10.1159/isbn.978-3-8055-8947-5. Läst 6 januari 2025
- ^ [a b c d] Themes, U. F. O. (11 augusti 2016). ”Caliciviridae: The Noroviruses” (på amerikansk engelska). Basicmedical Key 11 (3). doi:. https://doi.org/10.3390/v11030286. Läst 6 januari 2025.