Malaysias MotoGP 2006 var ett race som kördes den 10 september på Sepang International Circuit .
Precis som året innan var det Valentino Rossi på en Yamaha och Loris Capirossi på en Ducati som gjorde upp om segern. Tvärtom mot året innan gick Rossi segrande ut striden, i en av MotoGP:s klassiska dueller. Dani Pedrosa kom på tredje plats, trots en bruten fot.
Plats
Förare
Märke
Grid
Kvaltid
1
Valentino Rossi
Yamaha
1
2.00,065
2
Loris Capirossi
Ducati
3
2.01,167
3
Dani Pedrosa
Honda
5
2.02,021
4
Nicky Hayden
Honda
2
2.01,043
5
Sete Gibernau
Ducati
6
2.02,181
6
John Hopkins
Suzuki
8
2.02,453
7
Kenny Roberts Jr.
KR
4
2.01,898
8
Casey Stoner
Honda
10
2.02,790
9
Marco Melandri
Honda
9
2.02,560
10
Colin Edwards
Yamaha
11
2.02,800
11
Chris Vermeulen
Suzuki
16
2.03,285
12
Carlos Checa
Yamaha
15
2.03,123
13
Randy de Puniet
Kawasaki
7
2.02,313
14
Makoto Tamada
Honda
13
2.02,918
15
Alex Hofmann
Ducati
17
2.04,706
16
James Ellison
Yamaha
18
2.05,023
17
José Luis Cardoso
Ducati
19
2.05,958
18
Toni Elías
Honda
14
2.03,102
19
Shinya Nakano
Kawasaki
12
2.02,832
Valentino Rossi
Dani Pedrosa
Nicky Hayden
Casey Stoner
Randy de Puniet
Makoto Tamada
Alex Hofmann
.svg){kind=small}
James Ellison