Bland annat driver regionen Akademiska sjukhuset i Uppsala och Lasarettet i Enköping. Akademiska sjukhuset är ett av två universitetssjukhus i Sjukvårdsregion Mellansverige, med många patienter även utanför Uppsala län. Enligt regionens hemsida ska deras service präglas av "kvalitet, effektivitet och omtanke".
Enheten Trafik och samhälle inom Region Uppsala är regional kollektivtrafikmyndighet. Den har ansvar för, upphandlar och utvecklar kollektivtrafiken i Uppsala län. Kollektivtrafiken bedrivs under varumärket UL. Regionen äger även produktionsbolaget Gamla Uppsala Buss.
Region Uppsala är en politiskt styrd organisation med regionfullmäktige som högsta beslutande organ. Regionstyrelsen har det verkställande politiska ansvaret och bereder ärenden som behandlas i regionfullmäktige.
Organisationen hette Landstinget i Uppsala län fram till 31 december 2016. Den nuvarande organisationen bildades 1 januari 2017 genom en sammanslagning av landstinget och Regionförbundet i Uppsala län. Huvudkontoret är Regionens Hus på Storgatan i centrala Uppsala.
Regionledningen presenterade 5 maj 2015 planerna på att omvandla landstinget till region, vilket skulle innebära en sammanslagning av landstinget och Regionförbundet Uppsala län.[1] Planerna hade stort stöd bland berörda parter och röstades igenom så att den nya regionen kunde bildas 1 januari 2017.[2]
Region Uppsala styrdes under mandatperioden 2022-2026 till en början av en koalition bestående av Moderaterna, Kristdemokraterna, Centerpartiet och Liberalerna. Ordförande i regionstyrelsen var moderaten Emilie Orring.[3]
Från 14 februari 2024 styrs Region Uppsala av en majoritetskoalition bestående av Socialdemokraterna, Vänsterpartiet, Centerpartiet och Miljöpartiet regionstyrelsens ordförande är socialdemokraten Helena Proos.
